食品商贸公司通常更注重食品的品质和来源，更强调食品的批发和销售。而副食批发部则更侧重于食品的种类和价格，更关注食品的采购和批发。

以上只是两者的一些基本区别，实际上两者在业务运营、管理方式等方面也存在一定的差异。