一个透明的玻璃瓶里面有蓝色的东西可能是蓝色液体或蓝色固体物质。具体是什么物质，需要进行化学分析或具体描述才能确定。蓝色物质可能是染料、溶液、颜料等等，在没有更多信息的情况下，无法确定具体是什么。