有很多，主要包括：

一是受到施工环境所限。由于该路段经过多个省份，诸如地形、气候等都有很大差异，施工遇到了不少挑战，导致施工节奏落后，延误开通时间。

二是技术问题。雅万高铁是印尼的首条高铁，需要安装复杂的铁路设施，这也是导致它延期开通的一个重要原因。

三是资金问题。雅万高铁项目总投资高达70亿美元，而印尼政府资金不足，必须依赖外资，但由于一些国家的经济情势不容乐观，使得外资投资减少，资金也很难筹集起来，导致该项目延期开通。