根据拼多多平台的规则，商家在拼多多上经营，需要缴纳一定的保证金。如果商家的保证金出现负数，拼多多方面可能会采取一些措施来弥补此部分的亏损，例如扣除商家在拼多多上的销售款项来弥补亏损。

如果商家拒不缴纳或无法弥补保证金负数的亏损，拼多多方面可能会采取法律诉讼的方式来维护自己的利益。因此，建议商家在拼多多上经营时严格遵守相关规定，及时缴纳保证金，以避免不必要的经济损失。