防止第三方查询通话记录的方法如下：关闭备份功能：手机系统开启通话记录备份功能，会将通话记录备份到云端。可以在手机设置中关闭通话记录备份功能，以避免别人查询到通话记录。

设置密码保护：可以设置密码或指纹识别来保护手机。设置后只有授权的人才能够查看通话记录。