洱海在遭受污染的时候，爆发过蓝藻。由于水质富营养化，湖中的氮、磷等微量元素含量过多，这些元素会促使水中生物大量繁殖，其中以蓝藻为主，形成“水华”和“赤潮”。当洱海水质恶化时，就可能发生这种情况。