爱尔兰哨笛和竖笛在多个方面存在显著的区别。

首先，从来源上看，爱尔兰哨笛是一种凯尔特乐器，有着悠久的历史，其地位在凯尔特音乐中相当于中国民乐中的竹笛或箫。而竖笛则是欧洲一种历史悠久的木管乐器，起源于15世纪的意大利，十六至十八世纪盛行于欧洲各国。

其次，从结构和发音原理上看，竖笛和哨笛基本相似，但指法略有不同。哨笛一般比较便宜，携带方便，样子很像中国的短笛，但音色、演奏风格以及演奏技巧却完全不同。哨笛的音色高亢、脱俗，有如画眉的啼叫，经常可以在一些音乐中听到，如爱尔兰画眉专辑，电影《泰坦尼克号》的主题曲《My Heart Will Go On》的前奏等。

总的来说，爱尔兰哨笛和竖笛虽然都属于木管乐器，但在来源、历史文化背景、音色和演奏技巧等方面都有明显的不同。