在速卖通半托管中不同店铺的组包，需要按照以下步骤进行：

首先，选择需要组包的商品，将其添加到购物车中。

其次，选择需要组合的店铺，将需要组合的商品添加到同一个订单中。

最后，进行付款操作，选择付款方式并确认订单信息，将订单提交到系统进行处理。在这个过程中，需要注意商品的不同来源和店铺的发货时间，以确保订单的合理性和准确性。