公司通过第三方缴纳五险一金是合法的。这种方式被称为“社保代理”或“社保外包”，是指企业将员工的五险一金缴纳及管理委托给专业的第三方服务机构代为办理。这样可以节省企业的人力成本，提高工作效率。

在我国，第三方缴纳五险一金的法律依据主要有：《中华人民共和国社会保险法》和《住房公积金管理条例》。根据这些法规，用人单位应当自用工之日起三十日内为其职工向社会保险经办机构申请办理社会保险登记。未办理社会保险登记的，由社会保险经办机构核定其应当缴纳的社会保险费。

同时，住房公积金管理中心也会责令公司限期办理住房公积金的缴存手续。逾期不办理的，处以罚款。因此，公司在遵守相关法规的前提下，通过第三方缴纳五险一金是合法的。

但请注意，企业在选择第三方服务机构时，应确保其具备合法资质和良好的信誉，以避免出现违法或滥用现象。同时，企业要确保员工的五险一金缴纳情况符合国家法规，并及时向员工提供相关待遇。