如果电脑连接了两个显示器，但不能将其中一个设置为主屏幕，可能是由于以下原因：

1. 显示器与GPU不兼容；

2. 显示器连接错误，需要将主显示器连接到GPU上；

3. 显示器驱动程序未更新或未正确安装。解决方法包括更新GPU驱动程序、重新连接主显示器、更改显示器连接顺序或重新安装显示器驱动程序。如果问题仍然存在，建议咨询电脑厂商或技术支持。