北京香水柠檬和广东香水柠檬存在一些区别。总体来说，它们在外形、香味、汁水、酸味强度等方面有明显的差异。

首先，在外形上，北京香水柠檬相较广东香水柠檬外形更圆胖，皮更薄，汁水更多，香气清新淡雅，酸味较重。而广东香水柠檬外形为椭圆形，汁水较少，香气浓烈，酸度较弱。其次，在香味方面，北京香水柠檬的香味清新淡雅，而广东香水柠檬的香味浓烈。

第三，在口感方面，北京香水柠檬口感醇厚，没有涩味，而广东香水柠檬口感略带涩味。

最后，在用途方面，北京香水柠檬常用于制作柠檬水，而广东香水柠檬则更多地用于制作柠檬茶。