国庆祁连山仍然值得去，因为祁连山拥有壮美的自然景观、独特的文化特色和丰富的野生动植物资源。即使在国庆期间，游客数量可能会增加，但是游览路线和景点选择得当仍然能够感受到祁连山的独特魅力。此外，国庆期间还有一些民俗活动和节庆活动，可以增加游览的趣味性和体验感。因此，如果喜欢大自然和文化旅游的人，国庆祁连山仍然是一个值得探索的好去处。