公司没缴纳社保的滞纳金由单位来承担。

用人单位不办理社保拖欠社保，若给社会保险基金、用人单位或者个人造成损失的，依法承担赔偿责任；并且由社会保险费征收机构责令限期缴纳或者补足，并自欠缴之日起，按日加收万分之五的滞纳金。