亚马逊店铺代注册委托运营书在一定程度上是有效的。在我国，许多企业会选择将亚马逊店铺的注册和运营委托给专业的代运营公司，这样可以节省企业自身的人力和时间成本，同时提高店铺运营效率。

在委托运营过程中，双方签订的委托运营书具有一定的法律效力。然而，为确保双方的权益，请在签订委托运营书时注意以下几点：

1. 明确双方的权利和义务：委托运营书中应明确双方在店铺运营过程中的权利和义务，包括商品上架、销售、售后服务、物流等方面的责任划分。

2. 明确合作期限：双方应在委托运营书中明确合作期限，以便在合同期满后双方可以自由选择是否继续合作。

3. 明确费用及支付方式：委托运营书中应明确双方在合作过程中产生的费用及支付方式，避免因费用问题产生纠纷。

4. 数据安全和保密：鉴于亚马逊店铺运营涉及用户数据和商业机密，双方应在委托运营书中明确数据安全和保密条款，确保双方的数据安全。

5. 违约责任：为保证合同的履行，双方应在委托运营书中明确违约责任，以便在双方违反合同约定时，对方可以依据合同追究违约责任。

6. 争议解决方式：双方应在委托运营书中约定争议解决方式，如协商、调解、仲裁或诉讼等，以便在出现争议时，双方可以依据约定解决问题。

总之，亚马逊店铺代注册委托运营书在一定程度上是有效的。为确保双方权益，请在签订合同时注意以上几点，并在合同执行过程中严格遵守约定。如有必要，双方还可以寻求专业律师的建议。