酵母菌是从自然界中分离出来的。

1. 酵母菌是一类单细胞真菌，存在于自然环境中，如空气、泥土、植物表面等。

科学家通常通过在这些环境中进行分离和纯化，得到酵母菌进行研究。

2. 酵母菌还可以通过酿酒等发酵过程中的自然产生而得到。

这是由于酸碱度、氧气浓度、温度、营养等因素的影响，使得酵母菌自然繁殖，促使食品的升华和生产。

总之，酵母菌是存在于自然界中的，科学家通过从自然环境中分离出来，或者通过发酵等过程得到的。