安徽宣城建有世界上唯一的扬子鳄保护区——宣城扬子鳄国家级自然保护区。野生扬子鳄的数量可能不足200条，其中约有40条为成年扬子鳄。

野生扬子鳄原生存在长江中下游的广大地区，由于人口稠密且近百年来发展较快，其栖息地不断被开发为耕地鱼塘等农业用地。扬子鳄的生存空间不断被压缩，直至上世纪七十年代野生扬子鳄数量以锐减至不到三百条，生存环境也被压迫至苏皖浙交界的狭小地带。扬子鳄的性情较温顺，一般不会主动攻击人。扬子鳄的温顺胆小也给偷猎者带来了可乘之机，借助一些简单的捕鱼工具就能捕猎扬子鳄。这也是野生扬子鳄数量一直在二百到三百条间徘徊波动的原因之一。