水晶扁珠和车轮珠在多个方面存在显著的区别。
首先，从形制上来看，水晶扁珠通常呈现扁平的形状，而车轮珠则呈现出车轮的造型，整体呈圆形。这种形状的差异使得它们在视觉效果和佩戴体验上有所不同。
其次，两者的用途也有所不同。水晶扁珠主要用于储存、链接、静心、清理、释放、回归等目的，是一种能量水晶，可以吸收、储存和传递能量。而车轮珠则更多地被用作装饰和配饰，如用于108佛珠手串的搭配中，起到美观和协调的作用。
此外，两者的制作材料和工艺也有所不同。水晶扁珠通常是由天然水晶制成，经过精细的切割和打磨工艺，呈现出晶莹剔透的外观。而车轮珠则可能是由多种材料制成，如绿松石等，制作工艺也可能因材料不同而有所差异。