农业工程师主要是运用工程技术和生物学知识解决电力、机械、电器化、水土保持、结构和农产品加工等农业问题。

在宏观方面，农业工程师主要研究如何科学利用水土资源、保障粮食安全、保护生态环境、促进人类健康等问题。

在微观方面，农业工程师主要致力于运用农业信息技术、精细农业技术、农业生物材料工程技术、机器视角和图像分析技术等高新技术推进农业工程技术的创新与进步，并进一步推动与国际农业工程领域的交流与合作。