当女生半夜告诉你她姨妈痛时，你可以这样回复：

“真的很好听到你现在感到不舒服。姨妈痛确实很难受，我知道这可能会让你整晚都感到不适。有没有什么我可以做的，或者我可以帮你准备些什么来让你感觉好一点呢？比如热水袋、暖宝宝或者是一些缓解疼痛的药物？”

这样的回复既表达了你对她的关心，也给出了具体的帮助建议，让她感到你的支持和关心。同时，也询问她是否需要帮助，让她感到被重视和照顾。