农村大病二次报销一般在当地的医保局或县级以上的医保机构报销。报销时需带齐相关资料，如身份证、医疗保险卡、门诊、住院等票据、医疗费用明细等，并根据相关规定填写报销申请表，医保机构会根据相关政策对医疗费用进行审核，并将符合规定的费用返还给患者或其家属。需要特别注意的是，不同地区的报销政策可能有所不同，具体报销流程需以当地医疗保险政策为准。