如果您已经交了5年的灵活就业险，现在公司开始为您交五险，那么两者之间确实存在一些区别。

首先，基本概念和缴纳主体不同。灵活就业险是针对未参加公司社保且没有任何社会保障人员参加的社会保险制度，主要由个人自愿缴纳。而公司交的五险则是由用人单位与职工本人按照一定比例共同缴费的。

其次，保障对象也有所不同。灵活就业险主要保障的是城乡居民，而公司交的五险则主要保障企业职工。

此外，缴纳险种和比例也存在差异。公司交的五险通常包括养老保险、医疗保险、工伤保险、生育保险和失业保险五个险种，而灵活就业险一般只包含医保和养老这两个险种。在缴费比例上，公司交的五险中各项保险的比例也有明确规定，而灵活就业险的缴费比例则可以根据个人情况进行选择。

至于您提到的已经交了5年的灵活就业险，现在公司开始为您交五险的情况，建议您咨询当地社保机构或公司人事部门，了解具体的衔接和转换流程。一般来说，之前的缴费记录是可以累计计算的，但具体的政策规定和操作流程可能因地区而异。

总之，公司交的五险和灵活就业险在多个方面存在区别，您可以根据自己的实际情况和需求选择合适的保险方式。同时，及时了解并遵守相关政策规定，确保自己的权益得到保障。