是的，自动驾驶时玩手机同样会被扣分。虽然车辆处于自动驾驶模式，但驾驶人仍然要保持警觉和集中注意力，随时准备接手控制。如果驾驶人因为玩手机而没有及时发现危险情况，可能会导致交通事故的发生。因此，无论是手动驾驶还是自动驾驶，一旦被交警发现使用手机，都会对驾驶人产生安全隐患，从而被扣分。所以，切勿开车时使用手机，保障自己和他人的安全。