如果发生了交通事故，并且保险公司已经赔偿了对方，但对方仍然起诉司机，司机应该积极配合保险公司进行调查，并尽可能提供相关证据来证明自己的清白。同时，司机应该与保险公司协商制定合理的赔偿方案，以尽快解决纠纷。

如果保险公司认为司机没有责任，那么司机应该尊重保险公司的决定，并积极维护自己的权益。