马云在中国的浙江省杭州市开设了阿里巴巴总部和阿里巴巴集团的各个分支机构。阿里巴巴总部位于杭州市西湖区，占地面积广阔，是一个现代化的办公和研发基地。此外，阿里巴巴还在全国各地设有多个分支机构和研发中心，包括北京、上海、深圳等城市。马云通过在这些地方开设厂房和办公场所，为阿里巴巴的发展提供了良好的基础和支持。