是的，一个机构可以同时在多个证券开户。这是因为一个机构可能需要在不同的证券市场上进行投资和交易，每个市场都需要单独的证券账户。此外，多个证券账户可以帮助机构实现股票多元化和风险分散。然而，该机构应该审慎开设多个账户，并确保遵守相关法规和规定，避免任何违法或欺诈活动。

此外，它应该具有清晰的操纵规定和流程，以有效地管理不同的账户。