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农村可耕地是宝贵的资源，建厂房会对农民的生产生活带来负面影响，需要依法进行处理。具体措施如下：

1.查明情况：对涉及建设厂房的农村可耕地进行调查评估，明确占用面积、土地性质、所有权等情况。

2.依法处理：根据土地管理法等相关法律法规，对建设厂房的行为进行处罚，要求返还未利用的农村可耕地，并进行相应的土地复垦和整治。

3.加强监管：强化土地使用和管理的监督机制，加大对农村可耕地违法占用和乱占乱用的处罚力度，保障农民的合法权益。

以上，希望能够协助解决你的问题。