在换水时同时加入亚甲基蓝和硝化细菌是不建议的。因为亚甲基蓝是一种阻断线粒体氧化的化学物质，而硝化细菌需要依赖线粒体进行能量代谢。同时加入亚甲基蓝会抑制硝化细菌的代谢活性，从而影响硝化作用的进行，降低水质清洁度。

因此，在进行水体处理时，应先加入硝化细菌，等硝化作用稳定后再加入亚甲基蓝进行消毒。这样可以确保流程的顺利进行，同时保证水质的安全和稳定。